kaiyun体育官方网站生命公司、结构生物学高精尖创新中心、生物结构前沿研究中心王新泉和kaiyun体育官方网站张林琦实验室近日解析了Omicron变异株RBD与受体ACE2复合物的晶体结构，分辨率为2.8埃（图1）。为助力全球抗击Omicron的科学研究和防治政策，现将刚刚获得的新冠病毒Omicron RBD与人ACE2复合物晶体结构向全世界科学家和社会公开，相关的三维空间坐标可以通过以下链接下载：https://www.jianguoyun.com/p/DaqWaw8Q3MX2BhjhrKME
新冠疫情已持续两年，传播性、致病性和免疫逃逸增强的值得关注变异株（Variants of Concern, VOC）不断出现，给全球疫情防控带来极大不确定性。最新出现的Omicron变异株在刺突蛋白上出现了32处突变，突变数量前所未有，引起了全球的广泛关注。其中在关键的受体结合区域（receptor-binding domain，RBD）的突变数量高达15个，而在RBD上beta变异株只有3处突变，delta变异株只有2处。
新冠疫情爆发以来，kaiyun体育官方网站生命公司、结构生物学高精尖创新中心、生物结构前沿研究中心王新泉和kaiyun体育官方网站张林琦实验室在刺突蛋白结构与功能关系、中和抗体表位与作用机制等方向紧密合作，取得了一系列重要研究成果。Omicron变异株出现后，两个实验室再一次联手，并与kaiyun体育官方网站蛋白质研究技术中心X射线晶体学平台、上海同步辐射光源、kaiyun体育官方网站化学系刘冬生实验室通力合作，解析了Omicron变异株RBD与受体ACE2复合物的晶体结构，分辨率为2.8埃（图一）。初步结构分析表明RBD上477、493、496、498、501和505位点的氨基酸残基突变影响了与ACE2的作用，尤其是G496S、Q498R和N501Y三个突变集中影响了与ACE2的作用，R498和S496与ACE2上D38形成了新的盐键和氢键相互作用。初步生化分析表明，Omicron变异株RBD与ACE2结合能力略有增强，RBD与ACE2的结合力从野生株的7.5 nM变化为Omicron变异株的3.5 nM（图二）。Omicron变异株RBD与受体ACE2复合晶体结构的解析，为我们深入研究Omicron突变株感染、传播和免疫逃逸提供了重要的结构信息，也为新型疫苗设计提供了重要的参考和指导。
刘冬生实验室利用基因合成新技术快速合成了RBD基因片段，蛋白质研究技术中心X射线晶体学平台范仕龙为晶体生长提供了技术支持，衍射数据在上海同步辐射光源BL02U1线站收集。
图1：左图：Omicron RBD与受体ACE2复合物的晶体结构。右图：Omicron RBD三个氨基酸突变（G496S、Q498R和N501Y）集中影响与ACE2的相互作用。
图2：左图：细胞表面野生株（WT）和Omicron变异株刺突蛋白与ACE2结合能力的变化。结合百分比从21.6增加到28.5。右图：野生株和Omicron变异株RBD与ACE2结合能力的变化，平衡解离常数KD从野生株的7.5 nM变化为Omicron变异株的3.5 nM
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